Gua Jepang merupakan jejak masa pendudukan Jepang di Yogyakarta dan sejumlah wilayah lain di Indonesia. Gua Jepang yang berada di Gunungkidul ada tiga, tepatnya berada di Kecamatan Purwosari, Kabupaten Gunungkidul.
Adapun mengenai sejarah Gua Jepang bermula dari niat Jepang mengambil alih dan menguasai Indonesia dari Pemeritah Hindia Belanda.
Mulanya, setelah Jepang menduduki Kota Yogyakarta, beberapa hari kemudian Jepang mulai melancarkan aksi propaganda. Semua aksi tersebut dilakukan melalui siaran-siaran radio yang langsung dipancarkan dari Tokyo. Adapun inti propaganda itu dikatakan bahwa Jepang adalah saudara tua orang-orang Asia, dan ingin membebaskan saudarasaudara Indonesia dari belenggu penjajahan Belanda. Jepang menyerukan propaganda dengan slogan menarik yakni Asia untuk bangsa Asia.
Dalam rangka mempertahankan kekuasaan di Indonesia, Pemerintah Jepang melakukan serangkaian usaha diantaranya adalah melakukan mobilisasi dan kontrol. Sebagai usaha untuk memperkuat pertahanan, penguasa Jepang merekrut para pemuda Indonesia dalam badan semi militer, selain itu juga membangun stasiun-stasiun pertahanan seperti pangkalan militer, pangkalan udara, dan gua-gua pertahanan yang kemudian populer dengan istilah Gua Jepang.
Gua-gua yang dibangun di sekitar pantai dengan gua-gua yang dibangun di daerah pegunungan merupakan satu kesatuan strategi pertahanan yang saling terkait.
Gua-gua yang ada di pegunungan antara satu dengan lainnya dihubungkan dengan fasilitas jalan-jalan berparit. Sebagaimana area militer pada umumnya, di tempat tersebut juga dilengkapi dengan lapangan untuk upacara atau keperluan-keperluan kemiliteran.