Pantai Watunene terletak di Padukuhan Ngasem, Kalurahan Tepus, Kapanewon Tepus, Gunungkidul, Daerah Istimewa Yogyakarta, atau berada dekat dengan Pantai Poktunggal, tepatnya berada di antara pantai Poktunggal dan Pantai Seruni.
Menuju Pantai Watunene, pengunjung harus melewati medan jalan berbatu yang masih terjal. Karena jalan masih cor blok, butuh kendaraan dengan jarak dari tanah yang tinggi. Untuk memudahkan wisatawan, saat ini warga di Kalurahan Tepus sudah menyediakan mobil jenis jip dengan penggerak 4×4 untuk memudahkan menuju kawasan pantai Watunene.
Pantai Watunene berada di bawah tebing yang cukup menjulang dengan pasir berwarna putih. Menuju bibir pantai harus dilakukan dengan menuruni tebing melalui jalan setapak yang cukup curam, sehingga butuh kehati-hatian. Meski begitu, sulitnya perjalanan akan terbayar saat sampai di bibir pantai oleh pemandangan indah.
Suasana sepi dengan hanya suara deru ombak sangatlah menentramkan sehingga Pantai ini cocok untuk wisatwan yang ingin healing ke Pantai.